Salah satu faedah utama fabrik perubatan ialah keupayaannya untuk membantu mencegah penyebaran jangkitan. Dalam tetapan penjagaan kesihatan, jangkitan boleh merebak dengan mudah daripada pesakit kepada pesakit, serta daripada pekerja penjagaan kesihatan kepada pesakit. Dengan menggunakan fabrik antimikrob, kemudahan penjagaan kesihatan boleh membantu mengurangkan risiko jangkitan dan meningkatkan hasil pesakit.
Selain penggunaannya dalam tetapan penjagaan kesihatan, fabrik perubatan juga digunakan dalam industri lain, seperti pemprosesan makanan dan persekitaran bilik bersih. Dalam tetapan ini, penggunaan fabrik steril adalah penting untuk mengekalkan persekitaran yang bersih dan selamat.